Años después, cuando Floyd salió de prisión, intentó recuperar la custodia del menor. Sin embargo, no consiguió hacerlo por las vías legales. El 12 de septiembre de 1994, cuando Michael tenía seis años, Floyd se lo llevó de su escuela.
La investigación posterior se prolongó durante años. Finalmente, durante conversaciones con agentes del FBI, Floyd reconoció haber provocado la desaparición del niño ese mismo día. Por ese hecho recibió una condena de 52 años de prisión.
Las autoridades también vincularon a Floyd con la desaparición de Cheryl Ann Commesso, una joven que había conocido a Suzanne. Por ese caso fue declarado culpable en Florida y recibió una sentencia de muerte.
A pesar de las numerosas investigaciones realizadas a lo largo de los años, el caso de Suzanne continuó conservando algunos interrogantes. Las circunstancias de su muerte fueron consideradas sospechosas por las autoridades, pero Floyd nunca reconoció haber sido responsable de lo ocurrido.
